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强强联合|单细胞cDNA合成扩增模块助力全长转录本测序

版权所有,转载请联系基因市场部
2019-07-05

2019年6月,基因有限公司独家代理的美国PacBio公司发布了Iso-seq 快速建库的制备指南。在该指南的样本制备部分,PacBio推荐使用NEBNext® 单细胞cDNA合成扩增模块(#E6421S/L)来完成全长转录本的反转录和扩增。

NEBNext®单细胞cDNA合成扩增模块的产品优势:

  • 起始量低:低至单个细胞或2pg total RNA,即可开始实验

  • 扩增效率高:更少的PCR循环数,更高的全长cDNA产量

  • 检测灵敏:可以用于检测低丰度转录本(TPM<5)

  • 高一致性:不同起始量及样本类型,均能保证转录本检测的一致性

  • 节省时间:采用快速、精简的工作流程,减少操作步骤和手动操作时间

  • 性价比高:现已加入NEB Q2“聚焦RNA”促销

NEBNext Kit与友商检测灵敏度对比。TPM = Transcripts per Kilobase Million. Panels show the number of transcripts detected within the following TPM ranges: 1-5, 5-10, 10-50 and >50 TPM. Increased identification of low abundance transcripts is observed with the NEBNext libraries.

每个样本不需要那么多数据量怎么办?

在cDNA扩增时,将NEBNext Single Cell cDNA PCR Primer和Iso-Seq Express cDNA PCR Primer替换成自己合成的带有标签的引物,用含有0.1mM EDTA的10mM Tris缓冲液稀释至12μM,使用体积不变。PacBio推荐的cDNA扩增引物序列见下表。扩增后的带标签的cDNA可以混在一起进行上机测序,每个cell最多可以混合12个样本。


基因有限公司作为PacBio中国区独家代理和NEB中国区最早的一批代理商,为您提供专业的测序解决方案和技术支持。欲了解更多产品详情,请留言或联系您身边的基因人。



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